益生菌有什么副作用？
先明确一点，没有绝对安全的药物，也没有绝对安全的食品。无论是药品还是食品，只要严格遵照医嘱或说明书使用，一般都是安全的。但如果不遵医嘱、不按说明书使用，那后果就严重了。 益生菌是定植于人体肠道内，能产生确切健康功效的物质，包括抗氧化功效、免疫调节作用等。目前研究得比较多的有乳酸菌属、双歧杆菌乳杆菌等；
市面上的益生菌主要来源于这些有益细菌的动物制剂，如酸奶、奶酪等发酵制品以及乳酸菌、双歧杆菌等活菌制剂。 虽然目前市面上大多数产品都是合格的，但是也不排除有不合格的产品出现，所以购买的时候还是要仔细。
一般来说，合格产品的副作用比较小甚至是没有，但由于个人体质不同，也有可能会出现过敏的症状，比如皮肤瘙痒、皮疹，甚至还有可能会腹泻、呕吐等等，此时就要及时停止服用，去医院就诊。 不过，需要特别注意的是，益生菌虽然对人体大有裨益，但它却是有“死活”之分的。
一般所说的益生菌，特指活的微生物。然而，如今市面上的很多益生菌制品，其中的益生菌已经失去了生命活力，即所谓的死菌。那么，这种死菌会不会对我们造成伤害呢？答案是肯定的。
由于胃肠道是一个相对充满有毒物质（胃酸、胆汁等）的环境，而活菌又必须在这样恶劣的环境中才能存活，多数的活菌都必须依靠其表面上的糖蛋白吸附在胃肠道黏壁上，避免被消化液分解破坏。一旦摄入过量，又没有及时经过消化道排出体外，那么在胃肠道中就会繁殖，从而对人体造成不良影响。 在选择益生菌的时候一定要看清楚，是否是活菌，如果含有防腐剂也应慎用。
在正常情况下，益生菌制剂是相当安全的，几乎无任何副作用，这一点在许多临床试验中都得到证实。因为益生菌本身就是人体正常的微生物，有些甚至就是从人体自身分离出来的。
迄今为止，仅有极少数关于应用益生菌治疗导致败血症的报道，且几乎都发生在免疫机能严重缺陷的病人身上，如严重早产儿、癌症病人、进行器官移植后大量应用免疫抑制剂的病人，他们根本不适于应用任何种类的微生物。只要不是这类情况使用，对人体也就不会有什么损害或不良反应，所以也无排异性。但是，有些临床应用效果还缺乏深入研究，有待进一步观察。
目前使用的益生菌，大部分来源于传统发酵食品，有的来自人体肠道，具有人体共生菌的特征。这些菌群对人类健康没有不良影响，也没有发现严重的副作用。目前所使用的益生菌与食品微生物和发酵剂所使用的微生物没有本质上的区别。因此，目前所用的益生菌本身是安全的，不良反应的发生，与服用剂量有关系。
目前的医学研究认为，可以作为人体益生菌的有：乳杆菌类、双歧杆菌类、酪酸菌、芽孢杆菌、酵母菌类、革兰式阳性有孢子杆菌。其中有的菌种是人体内的正常菌群，有的菌种在人体内有寄生现象。
对于益生菌，人体对其有自然的调控和平衡能力。如果人体功能正常，肠道内环境稳定，摄入的外来有益菌在完成传递信息和刺激后，就自然终止存活或被巨噬细胞吞噬清除。如果人体肠道内环境受某些因素被破坏，在肠道功能低下，或者人体免疫功能有缺陷的情况下，外来菌可能会在肠道内存活、增值，导致肠道内菌群失调，而发生一些功能紊乱的症状。
